《钢之炼金术师：香巴拉的征服者》是2003年的TV动画《钢之炼金术师》的剧场版作品，故事延续TV动画剧情，故事背景为1923年的德国慕尼黑。与漫画原作剧情没有任何关联。 承接2003年的TV动画版的故事，艾尔利克兄弟各自在两个不同世界生活，想尽办法期望能再次相见。弟弟阿尔冯斯·艾尔利克虽然凭着哥哥爱德华·艾尔利克的炼成而取回肉身，但失去了四年的记忆。他决定跟师傅泉重新修行炼金术，换上哥哥以前的装束的红衣踏上了寻找哥哥的路途。 爱德华通过门被卷到了无法使用炼金术的世界（即现实世界），处于1921年的德国慕尼黑，这时正是第一次世界大战后，德国正面临着恶性通货膨胀。为了寻找回到他原来世界的线索，便与他弟弟相似的另一个青年阿尔冯斯·海德利西一起做火箭的研究，两年的时光过去，仍然不能回去原本世界，这令爱德焦燥起来。1923年的德国，当时一场世界大战蓄势待发。 一日，与阿尔冯斯一同前往嘉年华会的爱德，遇到了一位名为“诺雅”的吉普赛女性。拥有不可思议力量的她，有着只要借由接触对方就能看见被接触者的内心及想法的能力。她是被当时德国人称为“次等民族”的吉普赛人中的一员，她们自称“罗姆（Roma）”。由于她的出现，使得爱德被卷入当时纳粹外围组织“极北之地协会（トゥーレ协会/Thule Society）”正要发起的计划。极北之地协会为寻找理想国“香巴拉”，利用已化作龙的恩维和爱德所画的炼成阵，终于成功打开了连结“炼金术世界”和“现实世界”的门。两个世界意外地连结在一起，令炼金术世界陷入绝大危机。两兄弟相见这个宿愿，跟前所未有的世界危机交织一起，艾尔利克兄弟怎样面对这个全新局面？